События фильма разворачиваются в ближайшем будущем в Японии.
Нобухико Комедзи - эксперт по роботам.
Он возглавлял проект Ковчег и создал робота Кикайдера.
После загадочной смерти Нобухико, Кикайдер начинает борьбу с Ковчегом, который сильно отклонился от своей первоначальной миссии